Történeti adatok igazolják, hogy a mai Szent Mihály plébánia az egykor, szintén a várban található Szent János plébánia utódja. Háza a régi Szent János plébánia helyén áll, mivel azonban a plébániatemplom újjáépítésére nem került sor, ezért a plébánia funkcióit a székesegyház vette át.
1828-ban Halász Ignátz mérte fel a Vármegyeházát és környékét, összeírása szerint a mai plébánia épületének helyén két kisebb ház állt. Ezek a város 1857-es térképén is láthatóak. A mai plébániaépület feltehetően 1873-74-ben épült meg, Kirovics József plébánosságához kötik. Mivel az épület soha nem állt műemlékvédelem alatt, ezért belső átalakításait nem dokumentálták, még a XX. század második felében sem.
